Ers dechrau'r pandemig, mae profion diagnostig wedi chwarae rhan hanfodol wrth reoli lledaeniad SARS-CoV-2, y firws sy'n achosiCOVID 19.Profion antigen cyflymperfformio gartref neu mewn lleoliad clinigol yn darparu canlyniadau mewn 15 munud neu lai.Po gynharaf y caiff person ddiagnosis, y cynharaf y gallant geisio sylw meddygol ac ynysu eu hunain oddi wrth eraill.Ond pan fydd amrywiadau newydd o'r firws yn ymddangos, efallai na fydd yr amrywiadau hynny'n cael eu canfod gan y profion hyn.
Mae'r rhan fwyaf o brofion antigen cyflym wedi'u cynllunio i ganfod y protein nucleocapsid SARS-CoV-2 neu N-protein.Mae'r protein hwn i'w gael yn helaeth mewn gronynnau firaol a phobl heintiedig.Pecyn prawf cyflyms fel arfer yn cynnwys dau wrthgyrff diagnostig gwahanol sy'n rhwymo i wahanol rannau o'r protein N.Pan fydd gwrthgorff yn rhwymo'r protein N mewn sampl, mae llinell liw neu signal arall yn ymddangos ar y pecyn prawf, gan nodi haint.
Mae Protein N yn cynnwys 419 o unedau strwythurol asid amino.Gall unrhyw un ohonynt gael eu disodli gan asid amino arall trwy dreiglad.Grŵp ymchwil dan arweiniad Ph.D.Aeth Philip Frank ac Eric Ortlund o Brifysgol Emory ati i ymchwilio i sut mae'r newid asid amino sengl hwn yn effeithio ar berfformiad prawf antigen cyflym.Fe wnaethant ddefnyddio techneg o'r enw sganio treiglad dwfn i asesu ar yr un pryd sut mae pob mwtaniad ym mhrotein N y firws yn effeithio ar rwymo i wrthgorff diagnostig.Cyhoeddwyd eu canlyniadau yn Cell ar Fedi 15, 2022.
Creodd yr ymchwilwyr lyfrgell gynhwysfawr o bron i 8,000 o dreigladau protein N.Mae'r amrywiadau hyn yn cyfrif am fwy na 99.5% o'r holl dreigladau posibl.Yna fe wnaethant werthuso sut roedd pob amrywiad yn rhyngweithio â 17 o wrthgyrff diagnostig gwahanol a ddefnyddiwyd mewn 11 o brofion antigen cyflym a oedd ar gael yn fasnachol, gan gynnwys rhai cyffredin.citiau cartref.
Asesodd y tîm pa fwtaniadau N-protein sy'n effeithio ar adnabod gwrthgyrff.Yn seiliedig ar y wybodaeth hon, fe wnaethant greu “proffil treiglad dianc” ar gyfer pob gwrthgorff diagnostig.Mae'r proffil hwn yn nodi mwtaniadau penodol yn y protein N a allai effeithio ar allu'r gwrthgorff i rwymo i'w darged.Dangosodd y dadansoddiad fod y gwrthgyrff a ddefnyddir ym mhrofion cyflym heddiw yn cydnabod ac yn rhwymo pob amrywiad yn y gorffennol a'r presennol o SARS-CoV-2 o bryder a phryder.
Er bod sawl gwrthgyrff diagnostig yn cydnabod yr un rhanbarth o'r protein N, canfu'r ymchwilwyr fod gan bob gwrthgorff lofnod unigryw o dreigladau dianc.Wrth i'r firws SARS-CoV-2 barhau i dreiglo a chynhyrchu amrywiadau newydd, gellir defnyddio'r data hwn i dynnu sylw at wrthgyrff cit prawf y gallai fod angen eu hailasesu.
“Mae adnabod unigolion heintiedig yn gywir ac yn effeithlon yn parhau i fod yn strategaeth hanfodol ar gyfer lliniaru COVID-19, ac mae ein hastudiaeth yn darparu gwybodaeth am dreigladau SARS-CoV-2 yn y dyfodol a allai ymyrryd â chanfod,” meddai Ortlund.“Mae’r canlyniadau a amlinellir yma yn caniatáu inni addasu’n gyflym i’r firws hwn wrth i amrywiadau newydd barhau i ddod i’r amlwg, gan gyflwyno goblygiadau clinigol ac iechyd cyhoeddus ar unwaith.”
Cefndir: Mae Mutation Deep Scan yn canfod treigladau dianc yn y niwcleocapsid SARS-CoV-2 gan ddefnyddio profion antigen cyflym sydd ar gael ar hyn o bryd.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, cell Ortlund EA.2022 Medi 15;185(19):3603-3616.e13.Y Weinyddiaeth Mewnol: 10.1016/j.cell.2022.08.010.Awst 29, 2022 PMID: 36084631.
Cyllid: Sefydliad Cenedlaethol Delweddu Biofeddygol a Biobeirianneg NIH (NIBIB), Sefydliad Cenedlaethol Diabetes, Clefydau Treulio ac Arennau (NIDDK) a Sefydliad Cenedlaethol Alergedd a Chlefydau Heintus (NIAID), Cymdeithas y Galon America.
Mae NIH Research Matters yn ddiweddariad wythnosol o ganfyddiadau ymchwil allweddol NIH a adolygwyd gan arbenigwyr NIH.Fe'i cyhoeddir gan Swyddfa Cyfathrebu a Materion Cyhoeddus Cyfarwyddwr y Sefydliadau Iechyd Cenedlaethol.